STUDI INTERAKSI SENYAWA ALKALOID Piper longum (L.) DENGAN PLASMEPSIN II DALAM SKRINING OBAT ANTIMALARIA
Abstract
Piperin, senyawa yang terkandung dalam Piper longum (L.) memiliki aktivitas antimalarial dengan mekanisme deregulasi Ubiquitin Proteasome System. 2BJU, suatu enzim Plasmepsin II dengan ligan IH4 memiliki aktivitas antimalaria dengan IC50 34nM. IH4 merupakan inhibitor Plasmepsin II yang memiliki cincin piperidin pada strukturnya yang juga dimiliki senyawa piperin dan beberapa senyawa alkaloid pada Piper longum (L.). Penelitian ini melakukan skrining agen antimalaria dengan melakukan penambatan molekul senyawa alkaloid yang terkandung dalam Piper longum (L.) terhadap enzim plasmepsin II serta melakukan studi interaksi antara ligan asli serta senyawa alkaloid dengan enzim plasmepsin II. Berdasarkan penelitian ini, didapatkan senyawa piperundecalidine memiliki energi paling rendah diantara senyawa alkaloid yang lain, namun tidak lebih rendah dibandingkan ligan asli dari Plasmepsin II (2BJU). Hal ini terjadi karena pada piperundecalidine hanya berinteraksi dengan asam amino pada 1 dari 6 binding pocket yang berperan penting dalam aktivitas antimalaria. Ligan asli Plasmepsin II, IH4, berinteraksi dengan asam amino penting pada 4 dari 6 binding pocket, yang menyumbangkan kestabilan ikatan lebih besar dibandingkan pada piperundecalidine.
Collections
- LSP-Conference Proceeding [1874]