• Login
    View Item 
    •   Home
    • UNDERGRADUATE THESES (Koleksi Skripsi Sarjana)
    • UT-Faculty of Mathematics and Natural Sciences
    • View Item
    •   Home
    • UNDERGRADUATE THESES (Koleksi Skripsi Sarjana)
    • UT-Faculty of Mathematics and Natural Sciences
    • View Item
    JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

    Skrining Virtual Basis 2-D Inhibitor Arachidonate 5-Lipoxygenase Menggunakan QSAR dan Model Docking Molekular

    Thumbnail
    View/Open
    Skripsi Millatie AR (Scan).pdf (5.819Mb)
    Date
    2022-06
    Author
    ROZANA, Millatie Afrih
    Metadata
    Show full item record
    Abstract
    Asma merupakan penyakit peradangan kronis pada saluran napas yang menyebabkan hipereaktifitas pada bronkus terhadap berbagai rangsangan . Obat yang dapat menghambat kerja 5LO salah satunya yaitu obat zileuton . Penelitian yang dilakukan menggunakan DEEPScreen berbasis machine learning dan Lipinski's Rule of Five atau aturan 5 Lipinski . Pemodelan struktur 2D menggunakan dataset sebanyak 832 molekul dari protein target ALOX5 dengan kode ChEMBL215 untuk calon obat asma baru . Tahap pertama yaitu dilakukan optimasi model yang menghasilkan model dengan akurasi tertinggi sebesar 0,802 . Model tersebut akan diskrining secara virtual melalui DEEPScreen - QSAR dan menghasilkan 682.204 senyawa aktif . Senyawa aktif kemudian diskrining kembali dengan RO5 Lipinski dan menghasilkan 397.874 . Hasil kedua skrining tersebut masih belum diketahui aktivitas / pIC50 sehingga perlu dilakukan prediksi menggunakan QSAR regresi serta dilakukan pemeringkatan aktivitas / pICso- Proses tersebut menghasilkan nilai loss . sebesar 1,0159 dan mean squared error sebesar 1,584 . Nilai RMSE yang diperoleh adalah 1,258 . Selanjutnya diperoleh nilai R sebesar 0,82 dan R2 sebesar 0,67 . Model CHEMBL314039 memiliki nilai pIC50 tertinggi sebesar 6,084 . Senyawa aktif hasil skrining virtual divalidasi menggunakan metode docking molekular dengan aplikasi AutoDock Vina dalam PyRx . Ligan uji yang paling berpengaruh terhadap protein target ALOX5 adalah CHEMBL220538 karena memiliki energi bebas terendah sebesar 9,9 kcal / mol . Selain itu dari hasil visualisasi , CHEMBL220538 memiliki ikatan hidrogen serta interaksi hidrofobik yang sama dengan ligan pembanding ( Zileuton)
    URI
    https://repository.unej.ac.id/xmlui/handle/123456789/108418
    Collections
    • UT-Faculty of Mathematics and Natural Sciences [3447]

    UPA-TIK Copyright © 2024  Library University of Jember
    Contact Us | Send Feedback

    Indonesia DSpace Group :

    University of Jember Repository
    IPB University Scientific Repository
    UIN Syarif Hidayatullah Institutional Repository
     

     

    Browse

    All of RepositoryCommunities & CollectionsBy Issue DateAuthorsTitlesSubjectsThis CollectionBy Issue DateAuthorsTitlesSubjects

    My Account

    LoginRegister

    Context

    Edit this item

    UPA-TIK Copyright © 2024  Library University of Jember
    Contact Us | Send Feedback

    Indonesia DSpace Group :

    University of Jember Repository
    IPB University Scientific Repository
    UIN Syarif Hidayatullah Institutional Repository