Validasi Desain Primer Deteksi Gen ndmA Enzim Demetilase pada Isolat Bakteri Pendegradasi Kafein Secara in Vitro

Abstract

Hasil penelitian menunjukkan bahwa isolat Pseudomonas plecoglossicida KAFS 34 mampu menghasilkan pita DNA tunggal dengan ukuran sebesar 211 bp. Keberhasilan amplifikasi pada sekuen tersebut menunjukkan bahwa fragmen DNA yang diamplifikasi merupakan gen target yaitu ndmA. Berdasarkan hasil analisis BLAST seluruh sekuen isolat menunjukkan tingkat kemiripan dengan bakteri dari genus Pseudomonas, dengan tingkat kemiripan yang bervariasi.