Analisis Keragaman Genetik Tanaman Anggrek Dendrobium Mutan Berbasis Marka ISSR (Inter Simple Sequence Repeat)

Abstract

Anggrek Dendrobium adalah tanaman hias dengan permintaan pasar global yang terus meningkat karena daya tarik estetika dan umur simpan bunga yang lama. Salah satu upaya pemuliaan untuk memperluas keragaman genetik anggrek ini adalah melalui induksi mutasi menggunakan agen kimia, di antaranya Ethyl Methane Sulfonate (EMS) dan kolkisin. Perubahan yang timbul akibat mutasi, baik pada tingkat morfologi maupun molekuler, perlu diidentifikasi secara sistematis. Salah satu metode yang digunakan untuk mendeteksi keragaman genetik pada level DNA adalah marka Inter Simple Sequence Repeat (ISSR), yang bekerja dengan mengidentifikasi polimorfisme akibat perbedaan panjang dan frekuensi repetisi pada lokus genetik. Berdasarkan latar belakang tersebut, penelitian ini dilakukan untuk menganalisis keragaman genetik dan morfologi pada tanaman anggrek Dendrobium mutan menggunakan marka ISSR. Penelitian menggunakan dua populasi tanaman anggrek mutan, yaitu 20 individu Dendrobium stratiotes hasil induksi kolkisin (DS1–DS20) dan 20 individu Dendrobium gabriella suryajaya hasil induksi EMS (DG1–DG20), masing-masing termasuk satu tanaman wild type sebagai pembanding. Pengamatan morfologi dilakukan secara kualitatif (bentuk ujung dan tepi daun) serta kuantitatif (tinggi tanaman, jumlah daun, jumlah anakan, diameter batang, kandungan klorofil, dan karakter bunga), yang kemudian dianalisis menggunakan Principal Component Analysis (PCA) dan analisis klaster untuk melihat pola pengelompokan fenotipik. Analisis genetik dilakukan melalui ekstraksi DNA daun, amplifikasi menggunakan 10 primer ISSR dengan metode PCR, serta visualisasi pita DNA menggunakan elektroforesis gel agarosa. Data pita DNA (ada/tidak ada) selanjutnya dianalisis menggunakan koefisien similaritas Jaccard, dikelompokkan dengan metode UPGMA dalam bentuk dendrogram, serta divalidasi melalui Principal Coordinate Analysis (PCoA)