MODIFIKASI SELULOSA SECARA MOLECULAR DOCKING MENGGUNAKAN AGEN CROSSLINK ASAM DIKARBOKSILAT

Abstract

Selulosa telah dimanfaatkan diberbagai bidang, salah satunya dimanfaatkan sebagai bahan penyerap pada industri popok maupun pembalut. Permasalahan penggunaan selulosa dalam bahan penyerap yakni daya serapnya 20 kali berat aslinya yang dirasa kurang. Penambahan SAP (Super Absorbent Polymer) dapat meningkatkan daya serapnya namun berdampak buruk terhadap lingkungan. Cara lain yang dapat dilakukan adalah dengan metode crosslink menggunakan agen crosslink asam dikarboksilat. Dimana interaksi selulosa dan asam dikarboksilat dapat dilihat menggunakan metode docking. Penelitian ini bertujuan menemukan asam dikarboksilat terbaik untuk crosslink selulosa. Penentuan asam dikarboksilat terbaik berdasarkan energi Gibbs hasil perhitungan docking serta interaksi antara selulosa dan asam dikarboksilat yang menghubungkan selulosa antar rantai. Penelitian ini menggunakan dua program docking yakni AutoDock Vina dan AutoDock 4.2.6. Selulosa (makromolekul) dan asam dikarboksilat (ligan) disiapkan dan diatur parameter gridbox menggunakan AutoDock Tools sebelum docking. Terdapat 5 ukuran grid yang digunakan dalam penelitian ini. Pada AutoDock Vina ligan dan makromolekul disiapkan menggunakan AutoDock Tools sedangkan parameter grid pada file conf.txt kemudian AutoDock Vina dijalankan. Sedangkan pada AutoDock 4.2.6 parameter grid diatur pada AutoDock Tools kemudian dijalankan AutoGrid kemudian AutoDock 4.2.6 dijalankan. Hasil perhitungan kedua program dilihat interaksinya yang sesuai menggunakan PyMol. Hasil perhitungan AutoDock Vina menghasilkan 9 konformasi sedangkan hasil perhitungan AutoDock 4.2.6 menghasilkan 10 konformasi. Setiap hasil perhitungan dipilih hasil terbaiknya. Ligan terbaik hasil perhitungan kedua software adalah asam adipat, dimana energi terendah hasil perhitungan AutoDock Vina sebesar -3,5 kcal/mol dan hasil perhitungan AutoDock 4.2.6 sebesar -2,55 kcal/mol.