Pengujian Potensi Alergenitas Coat Protein of Sugarcane Mozaic Virus Pada Tanaman Tebu Transgenik

Abstract

Tebu tahan sugarcane mosaic virus (SCMV) dirakit melalui overekspresi gen untuk coat protein (CP). Oleh karena itu, penelitian ini bertujuan menguji alergenitas CP-SCMV pada tebu transgenik. Pengujian alergenitas dilakukan melalui analisis in silico dan in vitro. Hasil analisis in silico dengan pensejajaran AllergenOnline FASTA full-length asam amino CP-SCMV menunjukkan tidak ada kesamaan dengan protein alergen. Namun demikian pada pensejajaran 80 mer, CP-SCMV mempunyai kemiripan di atas 35% dengan alergen, tetapi hasil ini memiliki kecenderungan positif palsu. Analisis in silico terhadap kemampuan cerna protease ditemukan adanya sisi pemotongan CP-SCMV oleh enzim pensin, trypsin dan chymotrypsin. Hasil ini dikonfirmasi lebih lanjut dengan analisis in vitro pencernaan gastrointestinal yang menunjukkan bahwa CP-SCMV terdegradasi oleh pepsin dan trypsin. Walaupun hasil analisis in vitro menunjukkan CP-SCMV kurang dipengaruhi oleh perlakuan panas dan hanya sedikit berkurang pada pemanasan 90 ºC selama 30 menit, tetapi mungkin fungsi protein telah rusak. Hasil penelitian ini menyimpulkan bahwa CP-SCMV pada tanaman tebu transgenik tahan virus tidak berpotensi sebagai alergen.