Desain Primer Internal Transcribed Spacer Its Sebagai Dasar Identifikasi Molekuler Anggrek Obat Dendrobium Discolor Lindl

Abstract

Perdagangan ilegal serta pemalsuan spesies anggrek obat Dendrobium discolor Lindl. yang belum berbunga tidak dapat diidentifikasi secara autentik melalui identifikasi secara morfologi karena tumbuhan tidak memiliki organ yang lengkap. Identifikasi molekuler yaitu DNA barcoding ITS mulai diterapkan sebagai metode alternatif untuk identifikasi spesies anggrek. Namun, primer universal ITS yaitu 17SE dan 26SE yang mengkode keseluruhan wilayah ITS (ITS1-5.8S-ITS2) pada Dendrobium discolor Lindl. menghasilkan amplicon yang cukup panjang yaitu ±900 bp. Permasalahan tersebut dapat diatasi dengan menggunakan sebagian sekuen barcode ITS yaitu mini barcode berdasarkan sekuen ITS1 atau ITS2 saja. Oleh karena itu, primer ITS yang dapat menghasilkan fragmen pendek namun tetap memiliki fungsi barcode (mini-barcode) perlu didesain untuk identifikasi molekuler anggrek obat Dendrobium discolor Lindl.