CLONING FRAGMEN cDNA SUCROSE TRANSPORTER (SUT) DARI PELEPAH TANAMAN TEBU (Saccharum officnarum L.)

Abstract

Tanaman tebu mengakumulasi sukrosa pada internoda batang dan tingkat akumulasinya sangat berpengaruh terhadap nilai rendemen. Translokasi sukrosa dari organ source ke organ sir& difasilitasi oleh SUT yang keberadaannya diatur oleh DNA SUT. Penelitian ini bertujuan untuk memperbanyak dan mengidentifikasi fragmen cDNA SUT dari pelepah daun tebu yang dapat digunakan sebagai probe untuk mempelajari karakteristik fisiologi SUT pada tingkat DNA. Fragmen oDNA SUT diisolasi dari pelepah daun tebu varietas PS 86-10029 melaui RT-PCR. Primer dirancang berdasakan daerah konservatif pada tingkat asam amino dari Saccharum fficinarum Sucrose Transparter (^SoSt//) 2A batang nomor aksesi AY-165599, Oryza sativa Sucrose Transporter (OsSUI) putative nomor aksesi yWl-464733, dan Oryza sativa Sucrose Transporter (OsSUI) mRNA nomor aksesi AAP-54842 dari NCBI. Perancangan primer menghasilkan primer forward, yaitu SUT-F (5'CAGATCCTTCAACAGTTCGC3') dan primer reverse, yaitu SUT-R (5'TGCCCTTTGTCTCCGGAACC3'). Kloning dilakukan dalam plasmid pGEMT Easy sebagai vektor kloning dan Escluricia coli sf:ain DHSa sebagai sel inang. Keberhasilan kloning dapat dianalisis dengan enzim restriksi EcoN dan hasil elektroforesis dalam 1% gel agarose menunjukkan adanya dua band; yaiw band pGEMT Easy 3015 bp, dan bond cDNA SUT 576 bp. Analisis skuensi dilakukan untuk mengetahui urutan basa-basa nukleotida pada fragmen cDNA SUT. Hasil homologi fragmen cDNA SUT melalui program Gerct1x 3.0 adalah 98.6% dengan SoS(/Idari batag tebu, 93.0o/o dengan SoSW dari daun tebu, 91.57o dengan ZmSUT,87.4% dengan SoSW 2Abatang tebu (AY- 1 65 5 99), dan 87 .lo/o dengan OsSLT (XM -4647 7 3).