PENILAIAN HASIL MOLECULAR DOCKING TURUNAN ZERUMBON SEBAGAI INHIBITOR PTP1B MENGGUNAKAN DOCK6

Abstract

Zerumbon merupakan senyawa dengan potensi biologis yang beragam. Salah satu diantaranya adalah kemampuannya dalam menurunkan kadar gula darah melalui penghambatan enzim Protein Tyrosine Phosphatase 1B (PTP1B). Enzim ini, berjumlah sangat signifikan di dalam jaringan yang mejadi target insulin seperti hati, otot dan lemak, yang berperan penting sebagai regulator negatif untuk tranduksi sinyal insulin. Percobaan in silico telah dilakukan di dalam lingkungan Linux melalui beberapa tahapan, yaitu preparasi komponen ligan dan protein, validasi metode in silico, docking molekular menggunakan DOCK6, analisis hasil dan visualisasi interaksi 3D ligan-protein. Visualisasi 3D dihasilkan menggunakan PLIP untuk memperlihatkan interaksi yang terjadi antara ligan uji dibandingkan dengan ligan native. Ligan uji, turunan zerumbon yang digunakan, adalah ZERPH01, ZERPH02 dan ZERPH03. Tidak ada satu pun ligan uji yang tidak mmepunyai aktivitas penghambatan (affinitas ikatan) yang lebih baik dibandingkan dengan zerumbon dan zerumbol. Jika dibandingkan dengan ligan native, ligan uji mempunyai aktivitas lebih rendah sebagai inhibitor PTP1B.